天工大模型
项目说明
案例背景
抗体类药物已被广泛批准用于治疗多种疾病,具有巨大的社会价值,尤其在病毒引起的传染病等方面发挥着重要作用。抗体药物市场空间快速发展,然而,传统的抗体设计方法效率低下、成本高昂,难以满足日益增长的临床需求。
案例简介
针对这些需求与挑战,昌平实验室联合昇思 MindSpore 打造的“天工”抗体设计模型应运而生。它是一种能够与实验进行交互、具备生物先验知识的生成式 AI,能够实现对非人源有效抗体的人源化,从而降低抗体实验研发成本。此外,它还能进一步优化具有功效的抗体的可成药性、降低生产成本,最终实现对可成药抗体的高效增值。它将为抗体药物的研发带来革命性的变革。
“天工”抗体设计模型是基于昇思 MindSpore 打造的一款创新工具,能够实现抗体功能设计、序列嫁接和活性预测等多种任务。天工模型设计效率相比传统抗体设计方法提升一个数量级以上,基于天工模型嫁接改造得到的人源抗体,经协和医学院团队验证抗体表达量提升约 5 至 10 倍,有望将抗体生产成本降低 2 倍以上。

“天工”抗体设计模型是业界多领域交叉融合的杰出成果。依托昇腾硬件与昇思 MindSpore AI 框架的基础软硬件能力, “天工”模型实现高效训练和推理。昌平实验室则为该模型注入了抗体设计领域的生物先验知识,使其能够同时支持高精度的功能设计和嫁接设计。协和医学院以其丰富的临床经验,迅速对新设计的抗体进行实验验证,并将湿实验结果反馈至模型,形成了干湿实验的闭环,为“天工”模型的完善和应用提供了强有力的支持。
案例优势
1、软件协同:高效内存复用,模型性能提升
昇思 MindSpore 结合框架高效的内存复用能力,使用了重计算技术对模型进行优化。该技术网络正向执行是释放激活层的计算结果,在模型反向计算时重新计算正向激活层的结果,有效降低峰值内存,最终将训练内存减少了 10 倍。lazy inline 编译优化技术,能标记循环体中频繁调用的子图,推迟 inline 处理至编译的最后阶段,大幅度缩短了编译时间,将“天工”模型的编译性能提升了 5 倍以上。
2、高效设计:降低研发成本,加速临床应用
传统抗体研发投入成本高,导致许多抗体开发商长期亏损,而人源抗体的湿实验成本也相对昂贵。“天工”模型通过多段功能区域的联合分布改造生成抗体序列,能够高效筛选出具有优良活性的抗体候选。经过实验验证,经过“天工”模型嫁接改造的抗体相较于原始抗体,表达产率提升了约 5~10 倍。这一显著提升的表达产率为生产环节带来了巨大的效益。表达产率的提升意味着在相同的生产周期内,可以获得更多的抗体产品,从而降低了单位抗体的生产成本。
3、智能预测:提升抗体活性,优化治疗效果
“天工”模型还具备强大的活性预测能力,能够准确预测抗体的生物活性,为优化抗体结构、提升治疗效果提供了有力依据。通过智能预测,研究人员可以更加精准地筛选出具有优良活性的抗体,提高药物研发的成功率。针对一个具有潜在癌症治疗功效的鼠源抗体选择作为人源化目标,通过“天工”模型进行嫁接后得到的抗体序列,相比于原始序列在人源性得分上达到了 70%以上的提升,人源性分数表示人源化后的抗体与人类抗体序列的一致性程度,通常较高的人源性分数表示临床免疫原性更低、稳定性更高。