Release Notes

MindSPONGE 1.0.0rc2 Release Notes

RASP & FAAST

  • [STABLE] RASP & FAAST是昌平实验室高毅勤团队开发的蛋白质结构解析工具。RASP(Restraints Assisted Structure Predictor)模型能接受抽象或实验约束,使它能根据抽象或实验、稀疏或密集的约束生成结构,可用于多种应用,包括改进多结构域蛋白和msa较少的蛋白的结构预测。FAAST(iterative Folding Assisted peak ASsignmenT)方法通过结合RASP与传统核磁共振数据解析方法,实现了核磁共振数据全自动解析。

Bug Fixes

  • [I8G9N5] 修复SPONGE中的分子模拟样例tutorial_b01.py get_item报错问题。

  • [I78EJO] 修复mindsponge.cell.TriangleAttention问题(shape不一致)。

  • [I7QZVK] 修复MEGA-Protein支持序列长度与文档不一致的问题。